O Programa organiza-se em três Linhas de Pesquisa:

1. Ciências Sociais e Humanas em Saúde

Investiga o processo saúde-doença-cuidado sob perspectivas teórico-metodológicas das ciências humanas e sociais.
Abrange estudos sobre:

• Determinantes sociais da saúde;
  
• Análise de políticas públicas;
  
• Processos de trabalho em saúde;
  
• Participação social e controle social.
  

2. Epidemiologia

Desenvolve estudos epidemiológicos, clínicos e farmacoepidemiológicos voltados à análise situacional em saúde.
Abrange estudos sobre:

• Investigação de agravos relevantes;
  
• Uso de sistemas de informação em saúde;
  
• Avaliação de indicadores;
  
• Produção de evidências para subsidiar políticas públicas.
  

3. Política, Planejamento e Gestão da Saúde

Foca na formulação, implementação e avaliação de políticas e redes de atenção.
Abrange estudos sobre:

• Organização de serviços;
  
• Planejamento regional;
  
• Avaliação de sistemas de saúde;
  
• Gestão do cuidado e governança.