A Universidade Federal de Santa Maria (UFSM) é uma instituição consolidada situada no estado do Rio Grande do Sul, a qual foi pioneira no processo de interiorização do Ensino Superior no Brasil. A UFSM oferece diversos cursos de graduação e pós-graduação, reconhecidos em nível de excelência nacional e internacional. O curso de Mestrado em Ciências Biológicas: Bioquímica Toxicológica da UFSM foi criado em 1998, a partir da evolução do quadro de professores do Setor de Bioquímica do Departamento de Química. 

    Em 1990, os professores do Setor de Bioquímica do Departamento de Química da UFSM eram mestres ou somente graduados. Ao final de 1996 já contabilizavam 7 doutores. Atualmente, estes professores fazem parte do Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular (DBBM), criado em 2014, no qual estão lotados 14 professores doutores que orientam neste PPG. Devemos ressaltar que ao quadro de professores do DBBM, juntam-se professores de outros Departamentos e Centros de Educação da UFSM e de outras Universidades, que trabalham com temas relacionados ao Programa. 

    A criação do Mestrado em Bioquímica Toxicológica foi motivada principalmente pelo enorme número de alunos de Iniciação Científica que eram orientados pelos professores de de Bioquímica, pela ausência de cursos de pós-graduação em Ciências Biológicas na região de Santa Maria e pela grande interação com os professores de Síntese Orgânica do Programa de Pós-Graduação em Química da UFSM. De fato, tal interação direcionou boa porcentagem das linhas de pesquisa em Bioquímica Toxicológica e tem proporcionado uma visão interdisciplinar da Bioquímica, Toxicologia e Química. 

    Por sua vez, o curso de doutorado foi criado no ano de 2003, avaliado como curso 5 pela CAPES. Atualmente, já diplomamos 331 mestres e 211 doutores, dos quais 12 mestres e 12 doutores foram titulados em 2020, demonstrando que se tratam de cursos consolidados. Na última avaliação realizada pela CAPES, o nosso PPG atingiu o conceito 6, tendo reconhecida sua excelência internacional. Dentre os fatores que deram origem ao Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas: Bioquímica Toxicológica (PPGBTox), destacamos os seguintes:
a) a carência de Programa de Pós em Ciências Biológicas nas áreas relacionadas ao curso;
b) o amadurecimento científico do corpo docente que iria compor o Mestrado; posteriormente a boa qualidade das dissertações de Mestrado (a produção científica em periódicos internacionais) leva a
abertura na sequência do curso de Doutorado;
c) a possibilidade de uma melhoria na infraestrutura de pesquisa alavancada por editais (financiada pela FAPERGS, CAPES, FINEP/CT-INFRA e pela interação com grupos de pesquisa local, nacional e
internacional);
d) a possibilidade de facilitar intercâmbios nacionais (doutorado sanduíche no Brasil) e programas especiais (DINTER);
e) a possibilidade de facilitar intercâmbios internacionais de alunos e pesquisadores (doutorado sanduíche (PDSE), convênio TWAS/CNPq, e agora o CAPES/PrInt);
f) a possibilidade de formação de pessoal docente e não docente para melhoria da qualidade do ensino de graduação na UFSM e em outras universidades da região;
g) a formação de pesquisadores na área de Bioquímica Toxicológica e áreas afins.
    A criação do curso de Doutorado em Bioquímica Toxicológica em Santa Maria cumpriu com as metas previamente estabelecidas, contribuindo na formação de pessoal, principalmente na área de Ciências Biológicas: Bioquímica e áreas afins na UFSM bem como no interior do Rio Grande do Sul. Além disso, a interação com o grupo de pesquisadores da Química favoreceu a criação de um curso de caráter interdisciplinar na região Sul do país. A interação com a Síntese Orgânica sempre foi intensiva, na qual aproximadamente 40% dos titulados de 98 até 2005 tiveram algum tipo de participação da Síntese Orgânica em suas dissertações e teses. Esta interação tem sido de extrema importância para o desenvolvimento de novas moléculas com potencial uso terapêutico (agentes neuroprotetores e quelantes para o tratamento de intoxicações com metais tóxicos, entre outras possibilidades) e também para um melhor entendimento, em nível molecular, dos efeitos tóxicos de diversos compostos. Outra interação a ser destacada é com o Hospital Universitário da UFSM (HUSM/EBSERH), o qual é o maior centro de referência em atendimento público da região central do Rio Grande do Sul. 

    O PPGBTox possui inúmeros artigos publicados envolvendo uma interdisciplinaridade entre Ciências Biológicas e a áreas biomédicas, particularmente envolvendo estudos sobre doenças crônico-degenerativas. Esses estudos visam elucidar, em nível molecular, aspectos toxicológicos associados a doenças agudas e crônicas (câncer de mama, de pulmão, de ovários, útero, diabetes, lúpus, esclerose múltipla, hipertensão, obesidade, entre outros) que acometem uma boa porcentagem da população brasileira e mundial. Salienta-se que esta interação envolveu farmacêuticos, enfermeiros, biólogos, químicos e médicos do HUSM, os quais se tornaram alunos do programa, obtendo títulos de Mestres e Doutores em Ciências Biológicas: Bioquímica Toxicológica. Este PPG, devido ao fato de possuir uma parte razoável das linhas de pesquisas com natureza interdisciplinar, é o PRIMEIRO na área de Bioquímica no Estado do Rio Grande do Sul com estas características. 

    Atualmente existe uma diversidade de grupos de pesquisa vinculados ao PPG (inclusive ampliando a temática da Biologia Molecular), os quais vêm contribuindo efetivamente na consolidação e aprimoramento das pesquisas e, por consequência, da qualidade das dissertações e teses. Desse modo, o Programa tem contribuído para a melhoria da formação de recursos humanos bem como para a melhoria tecnológica na área em questão, trazendo benefícios para toda comunidade da região de Santa Maria e do Estado do RS. Tais características de formação de recursos humanos em excelência, com conhecimento interdisciplinar e inserção social associada ao desenvolvimento regional, são considerados pontos fortes do PPG que se encontram em consonância com um conjunto de desafios institucionais utilizados como base para a construção do Plano de Desenvolvimento Institucional (PDI) da UFSM.