A estrutura curricular do PPGCF contém disciplinas obrigatórias para Mestrado e Doutorado, conforme regulamento de 2016: Seminários I, II, III e IV, Docência Orientada I, II, III e IV, Coorientação de Iniciação Científica I e II, Metodologia da Pesquisa e Métodos Estatísticos. As disciplinas eletivas são escolhidas pelo aluno, em concordância com o orientador, em função das especificidades da área de concentração, linhas e projetos de pesquisa. No ano de 2024, com a atualização do Regulamento Geral da Pós-Graduação, foi proposta a redução do número de créditos e das disciplinas obrigatórias para a conclusão dos cursos de Mestrado e Doutorado, conforme consta no regulamento atual do Programa (Portaria Normativa CCS/UFSM nº 007 de 09/09/2024). Neste sentido, uma revisão da estrutura curricular foi iniciada, com previsão de finalização em 2025. Assim, novas disciplinas estão sendo criadas e adaptadas, visando adequá-las às constantes tendências da área farmacêutica. Neste novo regulamento, para concluir o Mestrado, é necessário cumprir um mínimo de 16 créditos, dos quais 5 devem ser em disciplinas obrigatórias. (Seminários I, Docência Orientada I e Coorientação de Iniciação Científica) e 11 em disciplinas eletivas e/ou atividades complementares de pós-graduação – ACPG); no Doutorado, são 24 créditos, sendo 5 em disciplinas obrigatórias (Seminários II, Docência Orientada II e Coorientação de Iniciação Científica II) e 19 em disciplinas eletivas e/ou ACPG.